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32P-Postlabeling
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top
Beim 32P-Postlabeling handelt es sich um eine Methode zum Nachweis von DNA-Addukten.
Contents
β’ Einzelschritt
β’ Phosphorylierung
β’ Literatur
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Einzelschritt
Enzymatische Hydrolyse
Im ersten Schritt erfolgt eine enzymatische Hydrolyse der DNA mittels Nuklease und Phosphodiesterase. Als Produkte entstehen 3'-Monophosphate. Enthielt die DNA DNA-Addukte, so entsteht ein Gemisch aus Addukten und adduktfreien Nukleotiden.
Adduktanreicherung
Die Anreicherung ist fakultativ, erhΓΆht jedoch die Empfindlichkeit. In einem zweiten Schritt spaltet eine selektive P1-Nuklease das 3'-Phosphat von den normalen Nukleotiden ab. Die durch Addukte modifizierten Nukleotide sind abbauresistent, so dass es zu einer Anreicherung kommt.
Alternativ ist es auch mΓΆglich, mittels n-Butanol-Extraktion die Addukte mit hydrophober Struktur zu extrahieren und somit anzureichern.
Phosphorylierung
Zur Markierung der Nukleotide wird durch T4-Polynukleotid-Kinase ein radioaktiver Phosphatrest von [Ξ³-32P]-ATP auf die Nukleotide im Ansatz ΓΌbertragen. Es entstehen Desoxyribonukleosid-3'-[5'-32P]-bisphosphate.
Trennung und Nachweis
Mittels mehrdimensionaler DΓΌnnschichtchromatographie und Szintillation bzw. mittels HochleistungsflΓΌssigkeitschromatographie (HPLC) kann nun der Nachweis erfolgen. Die Nachweisgrenze liegt bei 1 Addukt auf 1010 N.
Literatur
β’ Ramesh C. Gupta: Enhanced Sensitivity of 32P-Postlabeling Analysis of Aromatic Carcinogen: DNA Adducts. in: Cancer Research, 45, 5656β5662, November 1985, (PDF).
β’ M. V. Reddy und K. Randerath: Nuclease P1-mediated enhancement of sensitivity of 32P-postlabeling test for structurally diverse DNA adducts. in: Carcinogenesis 7(1986) 1543β1551. PMID 3017601
β’ D. H. Phillips: Detection of DNA modifications by the 32P-postlabelling assay. in: Mut. Res., 378(1997) 1β12. PMID 9288880
β’ K. Randerath und E. Randerath: P-32 postlabeling methods for DNA adduct detection - overview and critical-evaluation. in: Drug Metab. Rev., 26(1994) 67β85. PMID 8082582
β’ K. Randerath, M. V. Reddy und R. C. Gupta: 32P-labelling test for DNA damage. in: PNAS, 78(1981) 6126β6129. PMID 7031643
β’ A. Weston: Physical methods for the detection of carcinogen-DNA adducts in humans. in: Mut. Res., 288(1993) 19β29. PMID 7686262
β’ A. Weston und M. C. Poirier in H. A. Milman und E. K. Weisburger (Editors): βHandbook of Carcinogen Testingβ.